MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 50757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013124	CGT	2	6	193786	193791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371005
4502	NC_013124	ATG	2	6	193803	193808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371005
4503	NC_013124	GAA	2	6	193829	193834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256371005
4504	NC_013124	GTC	2	6	193894	193899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371005
4505	NC_013124	GAG	2	6	193909	193914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371005
4506	NC_013124	GAA	2	6	193947	193952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256371006
4507	NC_013124	GTA	2	6	193965	193970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371006
4508	NC_013124	CGA	2	6	193976	193981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371006
4509	NC_013124	CAG	2	6	193986	193991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371006
4510	NC_013124	TCGT	2	8	194025	194032	0 %	50 %	25 %	25 %	256371006
4511	NC_013124	GAA	2	6	194049	194054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256371006
4512	NC_013124	AGG	2	6	194095	194100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371006
4513	NC_013124	TGG	2	6	194152	194157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371006
4514	NC_013124	CGA	2	6	194198	194203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371006
4515	NC_013124	GGA	2	6	194249	194254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371006
4516	NC_013124	GC	4	8	194293	194300	0 %	0 %	50 %	50 %	256371006
4517	NC_013124	GC	3	6	194308	194313	0 %	0 %	50 %	50 %	256371006
4518	NC_013124	AGCCGG	2	12	194319	194330	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256371006
4519	NC_013124	CCT	2	6	194354	194359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371007
4520	NC_013124	ACC	2	6	194362	194367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371007
4521	NC_013124	TGC	2	6	194371	194376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371007
4522	NC_013124	GTC	2	6	194382	194387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371007
4523	NC_013124	CGA	2	6	194389	194394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371007
4524	NC_013124	GAG	2	6	194757	194762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371008
4525	NC_013124	GCCGC	2	10	194822	194831	0 %	0 %	40 %	60 %	256371008
4526	NC_013124	CGG	2	6	194839	194844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371008
4527	NC_013124	GC	3	6	194862	194867	0 %	0 %	50 %	50 %	256371008
4528	NC_013124	GAG	2	6	194893	194898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371008
4529	NC_013124	GCGG	2	8	194949	194956	0 %	0 %	75 %	25 %	256371008
4530	NC_013124	CGA	2	6	194987	194992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371008
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4532	NC_013124	AGC	2	6	195040	195045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371008
4533	NC_013124	CGA	2	6	195077	195082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371008
4534	NC_013124	GCA	2	6	195119	195124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371008
4535	NC_013124	CGG	2	6	195179	195184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371008
4536	NC_013124	ATC	2	6	195273	195278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256371008
4537	NC_013124	CGT	2	6	195296	195301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371008
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4539	NC_013124	GGA	2	6	195358	195363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371008
4540	NC_013124	GC	3	6	195478	195483	0 %	0 %	50 %	50 %	256371008
4541	NC_013124	TCGAGA	2	12	195484	195495	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256371008
4542	NC_013124	CGA	2	6	195532	195537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371008
4543	NC_013124	GTG	2	6	195547	195552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371008
4544	NC_013124	TCGCG	2	10	195680	195689	0 %	20 %	40 %	40 %	256371008
4545	NC_013124	GCT	2	6	195713	195718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371008
4546	NC_013124	TCG	2	6	195724	195729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371008
4547	NC_013124	GCG	2	6	195786	195791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371008
4548	NC_013124	GCTCG	2	10	195824	195833	0 %	20 %	40 %	40 %	256371008
4549	NC_013124	GATC	2	8	195872	195879	25 %	25 %	25 %	25 %	256371008
4550	NC_013124	ACC	2	6	195895	195900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371008
4551	NC_013124	CGT	2	6	195938	195943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371008
4552	NC_013124	GC	3	6	195952	195957	0 %	0 %	50 %	50 %	256371008
4553	NC_013124	GCGAT	2	10	195992	196001	20 %	20 %	40 %	20 %	256371009
4554	NC_013124	GGA	2	6	196002	196007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371009
4555	NC_013124	TCG	2	6	196028	196033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371009
4556	NC_013124	GGC	2	6	196164	196169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371009
4557	NC_013124	GGC	2	6	196208	196213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371009
4558	NC_013124	CG	3	6	196227	196232	0 %	0 %	50 %	50 %	256371009
4559	NC_013124	CGC	2	6	196268	196273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371009
4560	NC_013124	ACG	2	6	196316	196321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371009
4561	NC_013124	TCG	2	6	196343	196348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371009
4562	NC_013124	CTGGCG	2	12	196354	196365	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256371009
4563	NC_013124	CGA	2	6	196373	196378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371009
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4565	NC_013124	GCG	2	6	196400	196405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371009
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4571	NC_013124	TGC	2	6	196550	196555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371009
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4574	NC_013124	TGG	2	6	196589	196594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371009
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4593	NC_013124	CAT	2	6	197105	197110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256371010
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4620	NC_013124	TCG	3	9	198019	198027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371011
4621	NC_013124	GTC	2	6	198030	198035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371011
4622	NC_013124	CGG	2	6	198050	198055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371011
4623	NC_013124	C	6	6	198081	198086	0 %	0 %	0 %	100 %	256371011
4624	NC_013124	CTT	2	6	198101	198106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256371011
4625	NC_013124	TCG	2	6	198115	198120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371011
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4628	NC_013124	TCCTCG	2	12	198223	198234	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	256371011
4629	NC_013124	TCG	2	6	198247	198252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371011
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4631	NC_013124	TGC	2	6	198322	198327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371011
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4643	NC_013124	CG	4	8	198994	199001	0 %	0 %	50 %	50 %	256371012
4644	NC_013124	CGT	3	9	199033	199041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371013
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4651	NC_013124	CGG	2	6	199204	199209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371013
4652	NC_013124	TGA	2	6	199291	199296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371013
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4654	NC_013124	TCGG	2	8	199317	199324	0 %	25 %	50 %	25 %	256371013
4655	NC_013124	GAT	2	6	199355	199360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371013
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4659	NC_013124	TCGT	2	8	199699	199706	0 %	50 %	25 %	25 %	256371014
4660	NC_013124	GTA	2	6	199758	199763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371014
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4722	NC_013124	CGC	2	6	203524	203529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371016
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4724	NC_013124	CGA	2	6	203610	203615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371016
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4728	NC_013124	TGC	2	6	203738	203743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371016
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4739	NC_013124	CGT	2	6	204282	204287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371016
4740	NC_013124	CG	3	6	204290	204295	0 %	0 %	50 %	50 %	256371016
4741	NC_013124	TTC	2	6	204300	204305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256371016
4742	NC_013124	TGGG	2	8	204339	204346	0 %	25 %	75 %	0 %	256371016
4743	NC_013124	TCCGC	2	10	204521	204530	0 %	20 %	20 %	60 %	256371016
4744	NC_013124	GTG	2	6	204600	204605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371017
4745	NC_013124	CGA	2	6	204635	204640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371017
4746	NC_013124	GC	3	6	204687	204692	0 %	0 %	50 %	50 %	256371017
4747	NC_013124	GGCG	2	8	204696	204703	0 %	0 %	75 %	25 %	256371017
4748	NC_013124	AGG	2	6	204751	204756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371017
4749	NC_013124	CGA	2	6	204765	204770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371017
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4753	NC_013124	GCT	2	6	204887	204892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371017
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4755	NC_013124	CCGC	2	8	204928	204935	0 %	0 %	25 %	75 %	256371017
4756	NC_013124	GAT	2	6	204951	204956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371017
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4760	NC_013124	GAT	2	6	205096	205101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371018
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4763	NC_013124	CG	3	6	205215	205220	0 %	0 %	50 %	50 %	256371018
4764	NC_013124	AGGC	2	8	205276	205283	25 %	0 %	50 %	25 %	256371018
4765	NC_013124	TGG	2	6	205310	205315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371018
4766	NC_013124	GCG	2	6	205390	205395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371018
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4768	NC_013124	GTC	2	6	205453	205458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371018
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4770	NC_013124	GCA	2	6	205578	205583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371018
4771	NC_013124	GCGA	2	8	205614	205621	25 %	0 %	50 %	25 %	256371018
4772	NC_013124	CGT	2	6	205644	205649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371018
4773	NC_013124	CG	3	6	205674	205679	0 %	0 %	50 %	50 %	256371018
4774	NC_013124	CGA	2	6	205701	205706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371018
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4781	NC_013124	TCGCGA	2	12	205953	205964	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256371019
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4800	NC_013124	GTC	3	9	206760	206768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371019
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4802	NC_013124	GCT	2	6	207038	207043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371020
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4804	NC_013124	CAG	2	6	207111	207116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371020
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4806	NC_013124	CGCTG	2	10	207155	207164	0 %	20 %	40 %	40 %	256371020
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4824	NC_013124	GTG	2	6	207672	207677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371021
4825	NC_013124	CGTCCT	2	12	207782	207793	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	256371021
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4830	NC_013124	GTC	2	6	208122	208127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371021
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4833	NC_013124	GC	3	6	208208	208213	0 %	0 %	50 %	50 %	256371021
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4836	NC_013124	TCG	3	9	208253	208261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371021
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4840	NC_013124	GCG	2	6	208391	208396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371022
4841	NC_013124	CGG	2	6	208402	208407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371022
4842	NC_013124	GTG	2	6	208418	208423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371022
4843	NC_013124	CGG	2	6	208428	208433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371022
4844	NC_013124	TCG	2	6	208434	208439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371022
4845	NC_013124	TGG	2	6	208487	208492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371022
4846	NC_013124	GC	4	8	208513	208520	0 %	0 %	50 %	50 %	256371022
4847	NC_013124	GCTCG	2	10	208595	208604	0 %	20 %	40 %	40 %	256371022
4848	NC_013124	CACGC	2	10	208608	208617	20 %	0 %	20 %	60 %	256371022
4849	NC_013124	TCGG	2	8	208626	208633	0 %	25 %	50 %	25 %	256371022
4850	NC_013124	ATG	2	6	208638	208643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371022
4851	NC_013124	CGA	2	6	208651	208656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371022
4852	NC_013124	GCT	2	6	208669	208674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371022
4853	NC_013124	GCTG	2	8	208779	208786	0 %	25 %	50 %	25 %	256371022
4854	NC_013124	GCC	2	6	208883	208888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371022
4855	NC_013124	CGG	2	6	209020	209025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371022
4856	NC_013124	GC	3	6	209032	209037	0 %	0 %	50 %	50 %	256371022
4857	NC_013124	CCGCG	2	10	209111	209120	0 %	0 %	40 %	60 %	256371022
4858	NC_013124	TCG	2	6	209130	209135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371022
4859	NC_013124	CGG	2	6	209216	209221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371022
4860	NC_013124	GATCG	2	10	209256	209265	20 %	20 %	40 %	20 %	256371022
4861	NC_013124	CGA	2	6	209269	209274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371022
4862	NC_013124	TCGTGG	2	12	209325	209336	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	256371022
4863	NC_013124	ACC	2	6	209369	209374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371022
4864	NC_013124	GCC	2	6	209375	209380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371022
4865	NC_013124	CCG	2	6	209536	209541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371023
4866	NC_013124	CGT	2	6	209559	209564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371023
4867	NC_013124	GCT	2	6	209691	209696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371023
4868	NC_013124	TCGC	2	8	209768	209775	0 %	25 %	25 %	50 %	256371023
4869	NC_013124	CG	4	8	209801	209808	0 %	0 %	50 %	50 %	256371023
4870	NC_013124	GATC	2	8	209820	209827	25 %	25 %	25 %	25 %	256371023
4871	NC_013124	GCTC	2	8	209837	209844	0 %	25 %	25 %	50 %	256371023
4872	NC_013124	TG	3	6	209891	209896	0 %	50 %	50 %	0 %	256371023
4873	NC_013124	CGA	2	6	209907	209912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371023
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4878	NC_013124	TCG	2	6	210074	210079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371023
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4880	NC_013124	GTC	2	6	210139	210144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371023
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4883	NC_013124	GTC	2	6	210256	210261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371023
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4885	NC_013124	GCT	2	6	210303	210308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371023
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4887	NC_013124	CGT	2	6	210417	210422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371023
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4891	NC_013124	GCTG	2	8	210548	210555	0 %	25 %	50 %	25 %	256371023
4892	NC_013124	CGT	2	6	210564	210569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371023
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4896	NC_013124	AG	3	6	210699	210704	50 %	0 %	50 %	0 %	256371024
4897	NC_013124	CGA	2	6	210761	210766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371024
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4905	NC_013124	TGA	2	6	211247	211252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371024
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4968	NC_013124	CAGC	2	8	213639	213646	25 %	0 %	25 %	50 %	256371027
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4979	NC_013124	CGG	2	6	214134	214139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371027
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4981	NC_013124	ACC	3	9	214201	214209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371027
4982	NC_013124	GGC	2	6	214260	214265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371027
4983	NC_013124	GCA	2	6	214299	214304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371027
4984	NC_013124	CGG	2	6	214310	214315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371027
4985	NC_013124	GCT	2	6	214392	214397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371027
4986	NC_013124	CAA	2	6	214398	214403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256371027
4987	NC_013124	AGC	2	6	214439	214444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371027
4988	NC_013124	ACC	2	6	214517	214522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371028
4989	NC_013124	CGGT	2	8	214560	214567	0 %	25 %	50 %	25 %	256371028
4990	NC_013124	TCG	2	6	214602	214607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371028
4991	NC_013124	GAGG	2	8	214655	214662	25 %	0 %	75 %	0 %	256371028
4992	NC_013124	TCG	3	9	214671	214679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371028
4993	NC_013124	CGA	2	6	214720	214725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371028
4994	NC_013124	GCA	2	6	214759	214764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371028
4995	NC_013124	TGG	2	6	214776	214781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371028
4996	NC_013124	GC	3	6	214819	214824	0 %	0 %	50 %	50 %	256371028
4997	NC_013124	TCG	2	6	214830	214835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371028
4998	NC_013124	TGC	2	6	214848	214853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371028
4999	NC_013124	GC	3	6	214852	214857	0 %	0 %	50 %	50 %	256371028
5000	NC_013124	GAC	2	6	214880	214885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371028

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